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                ★国家级科研机构

                   水文水资源与水利工程科学国家重点实验室

                   水资源高效利用与工程安全国家工程研究中心

                ★省部级科研机构

                   浅水湖泊综合治理与资源开发教育部重点实验室

                   海岸灾害及防护教育部重点实验室

                   岩土力学与堤坝工程教育部重点实验室

                   南方地区高效灌排与农业水土环境教育部重点实验室

                   水利水电工程安全教育部工程研究中心

                    疏浚技术教育部工程研究中心

                   可再生能源发电技术教育部工程研究中心

                    江苏省交通基础技术工程研究中心

                   江苏省岩土工程技术工程研究中心

                   江苏省循环经济工程中心

                   江苏省水灾害监控与决策支持系统工程中心

                   东部资源环境与持续发展研究中心

                   江苏省输配电装备技术重点实验室

                   江苏省大型工程地基基础稳定性与安全监控工程技术研究中心

                   江苏省建筑物裂缝控制工程技术研究中心

                   水利经济研究所

                   水利部水工金属结构安全检测中心

                   水利部水库移民经济研究中心

                   水利部人力资源研究院

                   水利政策法制研究与培训中心

                   江苏省水资源与可持续发展研究中心

                   江苏企业国际化发展研究基地—江苏省决策咨询基地

                   教育部城市环境与可持续发展联合研究中心

                    水利部水力发电工程重点实验室

                    水利部结构力学与水工结构工程重点实验室

                    水利部岩土工程重点实验室

                    水利部机电控制及自动化重点实验室

                    水利部河口海岸工程重点实验室

                   水利部节水园区

                ★国际合作科研机构

                   中德水资源研究所

                    中港水利建设3S技术应用联合实验室

                    中-荷环境岩土工程合作研究中心

                   中加瞬变流仿真与控制研究中心

                    中德海岸工程研究所

                    中美全球变化与水循环联合研究中心

                   中荷水研究中心

                ★市级科研机构

                   南京市土工合成材料工程研究中心

                    常州市数字化制造技术重点实验室

                   常州市输配电及节电技术重点实验室

                   州市传感网与环境感知重点实验室

                   南通麒麟彩票海洋与近海工程研究院

                ★校内主要研究机构

                新材料新能源研究开发院

                高等教育研究所

                水文预报研究所

                工程水文及水文气象研究所

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